Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTPBP4Q9BZE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms