Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MS4A8Q9BY19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A8Q9BY19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms