Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3Q9BXJ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms