Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
HIRIP3Q9BW71 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HIRIP3Q9BW71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
HIRIP3Q9BW71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms