Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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