Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAGR1Q9BTK6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms