Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTA3Q9BTC8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA3Q9BTC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTA3Q9BTC8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms