Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf70Q9BSU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf70Q9BSU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf70Q9BSU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf70Q9BSU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf70Q9BSU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf70Q9BSU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms