Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms