Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP3Q9BQQ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP3Q9BQQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms