Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RETNLBQ9BQ08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms