Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms