Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP9Q99956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms