Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPAT1Q99943 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPAT1Q99943 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms