Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRX2Q99811 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms