Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPAS2Q99743 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms