Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms