Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms