Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms