Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CICQ96RK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms