Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms