Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIC6Q96NY7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms