Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.5 ms