Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC43Q96MW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms