Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C12orf66Q96MD2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf66Q96MD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms