Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms