Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C2orf48Q96LS8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C2orf48Q96LS8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf48Q96LS8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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