Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms