Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GJD4Q96KN9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GJD4Q96KN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJD4Q96KN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms