Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP47Q96K76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP47Q96K76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms