Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC12Q96J65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCC12Q96J65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms