Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms