Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms