Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP4Q96G21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms