Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUB1Q96FW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms