Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNRIP1Q96F85 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms