Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239 ms