Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPS1Q96D71 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPS1Q96D71 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms