Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAF2Q96CS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms