Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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