Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX21Q969T3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms