Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRG4Q92954 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRG4Q92954 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms