Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFAP3Q92845 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFAP3Q92845 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms