Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB13Q92826 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms