Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BAP1Q92560 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms