Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms