Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN9Q8WX39 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms