Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC4Q8WW27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms