Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBR1Q8WVP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms