Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRHL3Q8TE85 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL3Q8TE85 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRHL3Q8TE85 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL3Q8TE85 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms